Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRNQ16849 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRNQ16849 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRNQ16849 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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