Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRNP35Q16560 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNRNP35Q16560 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRNP35Q16560 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms