Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
VPS72Q15906 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VPS72Q15906 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
VPS72Q15906 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
VPS72Q15906 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
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