Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TWIST1Q15672 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TWIST1Q15672 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TWIST1Q15672 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TWIST1Q15672 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TWIST1Q15672 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TWIST1Q15672 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms