Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDSNQ15517 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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