Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNN3Q15417 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CNN3Q15417 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms