Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB3GAP1Q15042 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB3GAP1Q15042 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAB3GAP1Q15042 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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