Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX17Q15036 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX17Q15036 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX17Q15036 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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