Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMD6Q15008 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD6Q15008 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD6Q15008 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms