Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHD4Q14839 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHD4Q14839 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHD4Q14839 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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