Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCINQ13939 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCINQ13939 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCINQ13939 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCINQ13939 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCINQ13939 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCINQ13939 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCINQ13939 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCINQ13939 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCINQ13939 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCINQ13939 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCINQ13939 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCINQ13939 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCINQ13939 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCINQ13939 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCINQ13939 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCINQ13939 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCINQ13939 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCINQ13939 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCINQ13939 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCINQ13939 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCINQ13939 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCINQ13939 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCINQ13939 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCINQ13939 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCINQ13939 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCINQ13939 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCINQ13939 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCINQ13939 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCINQ13939 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCINQ13939 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCINQ13939 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCINQ13939 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCINQ13939 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCINQ13939 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCINQ13939 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCINQ13939 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCINQ13939 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCINQ13939 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCINQ13939 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCINQ13939 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCINQ13939 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCINQ13939 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCINQ13939 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCINQ13939 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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