Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPSQ13938 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPSQ13938 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPSQ13938 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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