Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR4Q13639 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HTR4Q13639 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR4Q13639 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms