Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PICALMQ13492 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PICALMQ13492 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PICALMQ13492 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
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