Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MRPL49Q13405 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MRPL49Q13405 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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