Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB3BPQ13352 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB3BPQ13352 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB3BPQ13352 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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