Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAF1Q13077 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF1Q13077 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF1Q13077 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
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