Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRN3Q13033 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRN3Q13033 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRN3Q13033 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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