Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TROQ12816 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TROQ12816 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
TROQ12816 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TROQ12816 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TROQ12816 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TROQ12816 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TROQ12816 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TROQ12816 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TROQ12816 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TROQ12816 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TROQ12816 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TROQ12816 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TROQ12816 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TROQ12816 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TROQ12816 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TROQ12816 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TROQ12816 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TROQ12816 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TROQ12816 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TROQ12816 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TROQ12816 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TROQ12816 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TROQ12816 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TROQ12816 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TROQ12816 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
TROQ12816 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TROQ12816 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TROQ12816 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TROQ12816 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TROQ12816 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
TROQ12816 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TROQ12816 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
TROQ12816 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
TROQ12816 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TROQ12816 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TROQ12816 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TROQ12816 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TROQ12816 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TROQ12816 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TROQ12816 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TROQ12816 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TROQ12816 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TROQ12816 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TROQ12816 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TROQ12816 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TROQ12816 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TROQ12816 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TROQ12816 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TROQ12816 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TROQ12816 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TROQ12816 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TROQ12816 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TROQ12816 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TROQ12816 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TROQ12816 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TROQ12816 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TROQ12816 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TROQ12816 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TROQ12816 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TROQ12816 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TROQ12816 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TROQ12816 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TROQ12816 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TROQ12816 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TROQ12816 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TROQ12816 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TROQ12816 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TROQ12816 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TROQ12816 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TROQ12816 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TROQ12816 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TROQ12816 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TROQ12816 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TROQ12816 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TROQ12816 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TROQ12816 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TROQ12816 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TROQ12816 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TROQ12816 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TROQ12816 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TROQ12816 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TROQ12816 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TROQ12816 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TROQ12816 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TROQ12816 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TROQ12816 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TROQ12816 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TROQ12816 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
TROQ12816 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TROQ12816 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
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