Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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FOXO1Q12778 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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FOXO1Q12778 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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FOXO1Q12778 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXO1Q12778 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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FOXO1Q12778 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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FOXO1Q12778 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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FOXO1Q12778 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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FOXO1Q12778 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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FOXO1Q12778 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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