Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 SIT1YEL065W 1887 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 MMP1YLL061W 1752 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 OMS1YDR316W 1416 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 VBA1YMR088C 1689 nt5.72□□□□□ -1.49
SGO1Q08490 FRS2YFL022C 1512 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 COX26YDR119W-A 201 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ENT5YDR153C 1236 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 RPT3YDR394W 1287 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 RRP17YDR412W 708 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 HSP31YDR533C 714 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YGR273CYGR273C 525 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 MPM1YJL066C 759 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 GAT3YLR013W 426 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 CDA2YLR308W 939 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ECM15YBL001C 315 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 DOM34YNL001W 1161 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 POR1YNL055C 852 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 CSG2YBR036C 1233 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YPL113CYPL113C 1191 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 BBP1YPL255W 1158 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YSA1YBR111C 696 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 PEX32YBR168W 1242 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 IRS4YKR019C 1848 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ROG3YFR022W 2202 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 TEP1YNL128W 1305 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 HFI1YPL254W 1467 nt5.71□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 CST6YIL036W 1764 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 TBF1YPL128C 1689 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ATP6Q0085 780 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 CHO1YER026C 831 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 MOB2YFL034C-B 864 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 CSI1YMR025W 888 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.7□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YPK3YBR028C 1578 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YDL034WYDL034W 345 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 SEC28YIL076W 891 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YJL171CYJL171C 1191 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 NPA3YJR072C 1158 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 MAC1YMR021C 1254 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ERG29YMR134W 714 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YOL131WYOL131W 327 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 PIN2YOR104W 849 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 NUR1YDL089W 1455 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 FKH1YIL131C 1455 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 RNR3YIL066C 2610 nt5.69□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 SRP101YDR292C 1866 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YLH47YPR125W 1365 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ATO3YDR384C 828 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YHL044WYHL044W 708 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 APN1YKL114C 1104 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YNL143CYNL143C 393 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 VPS68YOL129W 555 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 SUT2YPR009W 807 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ECM3YOR092W 1842 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 TRP3YKL211C 1455 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YJR124CYJR124C 1347 nt5.68□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 RET1YOR207C 3450 nt5.67□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YER134CYER134C 537 nt5.67□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ARI1YGL157W 1044 nt5.67□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 TFB6YOR352W 1032 nt5.67□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 FLC3YGL139W 2409 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 VTC2YFL004W 2487 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YFT2YDR319C 825 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 SEC20YDR498C 1152 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 MND2YIR025W 1107 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ECM9YKR004C 1134 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YLR225CYLR225C 1224 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 RCE1YMR274C 948 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 RDL2YOR286W 450 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 MET16YPR167C 786 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 IFA38YBR159W 1044 nt5.66□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 MDM10YAL010C 1482 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 MKC7YDR144C 1791 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 GUP2YPL189W 1830 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 GPT2YKR067W 2232 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 PCL2YDL127W 927 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 UBC6YER100W 753 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 ATG33YLR356W 594 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 TOM40YMR203W 1164 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 SSU72YNL222W 621 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 YNL226WYNL226W 411 nt5.65□□□□□ -1.5
SGO1Q08490 CHL4YDR254W 1377 nt5.65□□□□□ -1.51
SGO1Q08490 MAL13YGR288W 1422 nt5.65□□□□□ -1.51
SGO1Q08490 SEC18YBR080C 2277 nt5.64□□□□□ -1.51
SGO1Q08490 MRE11YMR224C 2079 nt5.64□□□□□ -1.51
SGO1Q08490 PIB1YDR313C 861 nt5.64□□□□□ -1.51
SGO1Q08490 IPI1YHR085W 1005 nt5.64□□□□□ -1.51
SGO1Q08490 TFA2YKR062W 987 nt5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms