Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LOXL1Q08397 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms