Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 YOL024WYOL024W 519 nt4.85□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 ARG8YOL140W 1272 nt4.85□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 MTF2YDL044C 1323 nt4.85□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 RPT1YKL145W 1404 nt4.85□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 HRP1YOL123W 1605 nt4.85□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 BIT2YBR270C 1638 nt4.84□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 SHM1YBR263W 1473 nt4.84□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.84□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YDL172CYDL172C 480 nt4.84□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YLF2YHL014C 1218 nt4.84□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 RPR2YIR015W 435 nt4.84□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 TOM40YMR203W 1164 nt4.84□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 PSE1YMR308C 3270 nt4.84□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 DAK1YML070W 1755 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 DED81YHR019C 1665 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 SET4YJL105W 1683 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 SLT2YHR030C 1455 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 TUP1YCR084C 2142 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 OMA1YKR087C 1038 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YNL019CYNL019C 855 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YNL033WYNL033W 855 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YOR292CYOR292C 930 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 UBC4YBR082C 447 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YPR195CYPR195C 330 nt4.83□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 DON1YDR273W 1098 nt4.82□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YER134CYER134C 537 nt4.82□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 ERG26YGL001C 1050 nt4.82□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 PDE1YGL248W 1110 nt4.82□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 BUB3YOR026W 1026 nt4.82□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 ECM33YBR078W 1290 nt4.82□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 HXT5YHR096C 1779 nt4.82□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YGL185CYGL185C 1140 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 DBP8YHR169W 1296 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 NMD4YLR363C 657 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 TIF34YMR146C 1044 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 LST8YNL006W 912 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 PET20YPL159C 762 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 ATR1YML116W 1629 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 CDC19YAL038W 1503 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 IML2YJL082W 2196 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 SED4YCR067C 3198 nt4.81□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 GRS1YBR121C 2004 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 UBA2YDR390C 1911 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 SPC97YHR172W 2472 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YGL101WYGL101W 648 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 NVJ1YHR195W 966 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 PAN6YIL145C 930 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YKL107WYKL107W 930 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 MID2YLR332W 1131 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 CTR3YLR411W 726 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 GTR1YML121W 933 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 QDR1YIL120W 1692 nt4.8□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YDL119CYDL119C 924 nt4.79□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 DUO1YGL061C 744 nt4.79□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt4.79□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 LEM3YNL323W 1245 nt4.79□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 CKS1YBR135W 453 nt4.79□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 FKH1YIL131C 1455 nt4.79□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 OMS1YDR316W 1416 nt4.79□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 ARO9YHR137W 1542 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YHR045WYHR045W 1683 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 GEP3YOR205C 1671 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 PFA5YDR459C 1125 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 GRX4YER174C 735 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 ATP12YJL180C 978 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 MRP17YKL003C 396 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YNL143CYNL143C 393 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 MRPL22YNL177C 930 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YOR024WYOR024W 324 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YPL073CYPL073C 486 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 PDI1YCL043C 1569 nt4.78□□□□□ -1.64
SSK1Q07084 YGR022CYGR022C 330 nt4.77□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 MTC2YKL098W 1074 nt4.77□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 DCN1YLR128W 810 nt4.77□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 RPA49YNL248C 1248 nt4.77□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 CKA2YOR061W 1020 nt4.77□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 MAL13YGR288W 1422 nt4.77□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 YIL067CYIL067C 2037 nt4.77□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 STE20YHL007C 2820 nt4.77□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 GSH2YOL049W 1476 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 URA3YEL021W 804 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 ARN2YHL047C 1863 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 SPO16YHR153C 597 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 YLR124WYLR124W 345 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 PPG1YNR032W 1107 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 YPL062WYPL062W 405 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 ARR3YPR201W 1215 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 NUD1YOR373W 2556 nt4.76□□□□□ -1.65
SSK1Q07084 SEC39YLR440C 2130 nt4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms