Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNB3Q05901 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNB3Q05901 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms