Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFF2Q03403 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF2Q03403 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms