Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NHLH2Q02577 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms