Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TFAP4Q01664 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFAP4Q01664 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP4Q01664 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms