Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK3Q00526 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK3Q00526 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms