Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MAT1AQ00266 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms