Protein–RNA interactions for Protein: P62753

RPS6, 40S ribosomal protein S6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6P62753 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6P62753 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6P62753 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6P62753 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6P62753 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6P62753 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6P62753 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6P62753 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6P62753 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6P62753 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPS6P62753 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPS6P62753 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPS6P62753 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6P62753 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6P62753 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6P62753 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6P62753 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6P62753 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6P62753 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6P62753 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPS6P62753 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6P62753 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6P62753 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6P62753 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6P62753 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPS6P62753 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPS6P62753 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6P62753 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6P62753 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6P62753 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6P62753 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6P62753 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPS6P62753 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6P62753 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6P62753 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPS6P62753 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPS6P62753 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPS6P62753 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6P62753 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6P62753 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6P62753 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6P62753 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6P62753 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6P62753 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6P62753 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6P62753 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6P62753 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6P62753 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6P62753 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6P62753 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6P62753 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6P62753 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6P62753 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6P62753 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6P62753 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6P62753 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6P62753 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6P62753 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6P62753 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6P62753 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6P62753 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6P62753 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6P62753 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms