Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP46P62068 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP46P62068 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP46P62068 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP46P62068 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP46P62068 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP46P62068 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP46P62068 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP46P62068 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP46P62068 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP46P62068 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP46P62068 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP46P62068 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP46P62068 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP46P62068 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP46P62068 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP46P62068 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP46P62068 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP46P62068 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP46P62068 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP46P62068 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP46P62068 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP46P62068 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP46P62068 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP46P62068 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP46P62068 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP46P62068 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP46P62068 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP46P62068 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP46P62068 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP46P62068 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP46P62068 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP46P62068 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP46P62068 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP46P62068 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP46P62068 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP46P62068 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP46P62068 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP46P62068 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms