Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2FP61218 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2FP61218 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2FP61218 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms