Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF3P61204 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF3P61204 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF3P61204 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF3P61204 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF3P61204 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF3P61204 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF3P61204 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF3P61204 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARF3P61204 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF3P61204 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF3P61204 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF3P61204 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF3P61204 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF3P61204 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF3P61204 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARF3P61204 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARF3P61204 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF3P61204 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF3P61204 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF3P61204 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF3P61204 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF3P61204 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF3P61204 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF3P61204 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARF3P61204 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARF3P61204 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARF3P61204 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARF3P61204 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARF3P61204 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARF3P61204 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARF3P61204 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARF3P61204 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARF3P61204 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARF3P61204 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARF3P61204 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARF3P61204 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARF3P61204 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF3P61204 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF3P61204 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF3P61204 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF3P61204 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF3P61204 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF3P61204 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARF3P61204 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARF3P61204 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF3P61204 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF3P61204 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF3P61204 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF3P61204 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF3P61204 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF3P61204 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF3P61204 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF3P61204 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ARF3P61204 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARF3P61204 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARF3P61204 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARF3P61204 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARF3P61204 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARF3P61204 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARF3P61204 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARF3P61204 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARF3P61204 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF3P61204 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF3P61204 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF3P61204 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF3P61204 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARF3P61204 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms