Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2NP61088 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2NP61088 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2NP61088 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2NP61088 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2NP61088 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2NP61088 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2NP61088 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2NP61088 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2NP61088 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2NP61088 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms