Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSX2P58304 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSX2P58304 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSX2P58304 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VSX2P58304 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX2P58304 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX2P58304 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX2P58304 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX2P58304 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX2P58304 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX2P58304 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX2P58304 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSX2P58304 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSX2P58304 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX2P58304 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX2P58304 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX2P58304 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX2P58304 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX2P58304 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSX2P58304 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX2P58304 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX2P58304 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX2P58304 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX2P58304 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSX2P58304 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX2P58304 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX2P58304 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX2P58304 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX2P58304 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX2P58304 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX2P58304 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX2P58304 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX2P58304 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSX2P58304 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX2P58304 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX2P58304 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX2P58304 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX2P58304 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX2P58304 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSX2P58304 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms