Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
AFDNP55196 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AFDNP55196 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AFDNP55196 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AFDNP55196 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
AFDNP55196 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
AFDNP55196 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFDNP55196 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFDNP55196 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFDNP55196 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFDNP55196 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFDNP55196 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AFDNP55196 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFDNP55196 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFDNP55196 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFDNP55196 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFDNP55196 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFDNP55196 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFDNP55196 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFDNP55196 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFDNP55196 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFDNP55196 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFDNP55196 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFDNP55196 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFDNP55196 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFDNP55196 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFDNP55196 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFDNP55196 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFDNP55196 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFDNP55196 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFDNP55196 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
AFDNP55196 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AFDNP55196 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
AFDNP55196 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
AFDNP55196 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AFDNP55196 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
AFDNP55196 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFDNP55196 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFDNP55196 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFDNP55196 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFDNP55196 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFDNP55196 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFDNP55196 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AFDNP55196 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AFDNP55196 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
AFDNP55196 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
AFDNP55196 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFDNP55196 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFDNP55196 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFDNP55196 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFDNP55196 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFDNP55196 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
AFDNP55196 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFDNP55196 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
AFDNP55196 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AFDNP55196 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
AFDNP55196 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
AFDNP55196 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFDNP55196 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFDNP55196 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFDNP55196 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFDNP55196 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFDNP55196 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFDNP55196 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFDNP55196 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
AFDNP55196 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
AFDNP55196 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
AFDNP55196 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms