Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACLYP53396 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACLYP53396 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACLYP53396 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACLYP53396 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACLYP53396 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACLYP53396 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACLYP53396 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACLYP53396 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACLYP53396 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACLYP53396 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACLYP53396 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACLYP53396 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACLYP53396 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACLYP53396 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACLYP53396 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACLYP53396 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACLYP53396 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACLYP53396 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACLYP53396 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACLYP53396 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACLYP53396 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACLYP53396 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACLYP53396 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACLYP53396 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACLYP53396 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACLYP53396 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACLYP53396 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACLYP53396 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACLYP53396 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACLYP53396 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACLYP53396 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACLYP53396 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACLYP53396 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACLYP53396 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACLYP53396 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACLYP53396 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACLYP53396 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACLYP53396 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACLYP53396 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACLYP53396 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACLYP53396 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACLYP53396 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACLYP53396 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACLYP53396 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACLYP53396 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACLYP53396 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ACLYP53396 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACLYP53396 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACLYP53396 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACLYP53396 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACLYP53396 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ACLYP53396 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACLYP53396 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACLYP53396 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACLYP53396 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACLYP53396 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACLYP53396 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACLYP53396 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACLYP53396 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACLYP53396 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACLYP53396 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACLYP53396 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACLYP53396 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACLYP53396 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACLYP53396 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACLYP53396 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACLYP53396 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACLYP53396 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACLYP53396 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACLYP53396 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACLYP53396 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACLYP53396 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACLYP53396 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACLYP53396 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACLYP53396 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACLYP53396 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACLYP53396 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACLYP53396 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACLYP53396 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACLYP53396 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACLYP53396 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms