Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms