Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NUP153P49790 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NUP153P49790 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NUP153P49790 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NUP153P49790 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NUP153P49790 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
NUP153P49790 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NUP153P49790 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NUP153P49790 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NUP153P49790 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
NUP153P49790 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NUP153P49790 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
NUP153P49790 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NUP153P49790 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NUP153P49790 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NUP153P49790 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NUP153P49790 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NUP153P49790 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NUP153P49790 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NUP153P49790 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NUP153P49790 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NUP153P49790 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP153P49790 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP153P49790 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP153P49790 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP153P49790 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP153P49790 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP153P49790 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NUP153P49790 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NUP153P49790 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NUP153P49790 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NUP153P49790 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NUP153P49790 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NUP153P49790 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NUP153P49790 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NUP153P49790 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NUP153P49790 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NUP153P49790 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NUP153P49790 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NUP153P49790 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NUP153P49790 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NUP153P49790 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NUP153P49790 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
NUP153P49790 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
NUP153P49790 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NUP153P49790 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NUP153P49790 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NUP153P49790 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NUP153P49790 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NUP153P49790 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NUP153P49790 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NUP153P49790 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NUP153P49790 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NUP153P49790 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NUP153P49790 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NUP153P49790 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP153P49790 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP153P49790 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP153P49790 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP153P49790 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP153P49790 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP153P49790 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP153P49790 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NUP153P49790 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NUP153P49790 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NUP153P49790 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NUP153P49790 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NUP153P49790 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NUP153P49790 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NUP153P49790 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NUP153P49790 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NUP153P49790 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NUP153P49790 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUP153P49790 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUP153P49790 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUP153P49790 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUP153P49790 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUP153P49790 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUP153P49790 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUP153P49790 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NUP153P49790 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NUP153P49790 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NUP153P49790 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NUP153P49790 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NUP153P49790 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP153P49790 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP153P49790 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP153P49790 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP153P49790 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP153P49790 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP153P49790 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms