Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CX3CR1P49238 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms