Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPA13P48723 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPA13P48723 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPA13P48723 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPA13P48723 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPA13P48723 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HSPA13P48723 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSPA13P48723 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPA13P48723 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms