Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTX2P47972 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX2P47972 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTX2P47972 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms