Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 CDC43YGL155W 1131 nt5.01□□□□□ -1.61
MDE1P47095 SHP1YBL058W 1272 nt5.01□□□□□ -1.61
MDE1P47095 PIN2YOR104W 849 nt5.01□□□□□ -1.61
MDE1P47095 YPR195CYPR195C 330 nt5.01□□□□□ -1.61
MDE1P47095 UTP7YER082C 1665 nt5.01□□□□□ -1.61
MDE1P47095 TDA11YHR159W 1515 nt5.01□□□□□ -1.61
MDE1P47095 BRF1YGR246C 1791 nt5.01□□□□□ -1.61
MDE1P47095 STP4YDL048C 1473 nt5□□□□□ -1.61
MDE1P47095 SHM1YBR263W 1473 nt5□□□□□ -1.61
MDE1P47095 RIM15YFL033C 5313 nt5□□□□□ -1.61
MDE1P47095 ORC5YNL261W 1440 nt5□□□□□ -1.61
MDE1P47095 HIS4YCL030C 2400 nt5□□□□□ -1.61
MDE1P47095 NQM1YGR043C 1002 nt5□□□□□ -1.61
MDE1P47095 DAK1YML070W 1755 nt5□□□□□ -1.61
MDE1P47095 TGL4YKR089C 2733 nt5□□□□□ -1.61
MDE1P47095 STB2YMR053C 2553 nt5□□□□□ -1.61
MDE1P47095 SIR2YDL042C 1689 nt4.99□□□□□ -1.61
MDE1P47095 CDC4YFL009W 2340 nt4.99□□□□□ -1.61
MDE1P47095 ACT1YFL039C 1128 nt4.99□□□□□ -1.61
MDE1P47095 PGA3YML125C 939 nt4.99□□□□□ -1.61
MDE1P47095 SNO4YMR322C 714 nt4.99□□□□□ -1.61
MDE1P47095 SOL1YNR034W 966 nt4.99□□□□□ -1.61
MDE1P47095 HSP33YOR391C 714 nt4.99□□□□□ -1.61
MDE1P47095 HSP32YPL280W 714 nt4.99□□□□□ -1.61
MDE1P47095 GPR1YDL035C 2886 nt4.99□□□□□ -1.61
MDE1P47095 DXO1YDR370C 1329 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 HES1YOR237W 1305 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 MAD3YJL013C 1548 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 ABF1YKL112W 2196 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 YDR154CYDR154C 351 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 GLO2YDR272W 825 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 YER134CYER134C 537 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 CBP4YGR174C 513 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 SNN1YNL086W 309 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 UIP4YPL186C 915 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 KTR7YIL085C 1554 nt4.98□□□□□ -1.61
MDE1P47095 MPH2YDL247W 1830 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 YGR125WYGR125W 3111 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 COQ4YDR204W 1008 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 MRF1YGL143C 1242 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 YKR041WYKR041W 753 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 NAT5YOR253W 531 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 TDA7YNL176C 1911 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 APM2YHL019C 1818 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 NNK1YKL171W 2787 nt4.97□□□□□ -1.61
MDE1P47095 FAA3YIL009W 2085 nt4.96□□□□□ -1.61
MDE1P47095 CLF1YLR117C 2064 nt4.96□□□□□ -1.61
MDE1P47095 ARH1YDR376W 1482 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 CAF4YKR036C 1932 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 FOL1YNL256W 2475 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 VMA16YHR026W 642 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 CSL4YNL232W 879 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 TSL1YML100W 3297 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 HXT7YDR342C 1713 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 HXT6YDR343C 1713 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 ERG4YGL012W 1422 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 SMF3YLR034C 1422 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 GEP3YOR205C 1671 nt4.96□□□□□ -1.62
MDE1P47095 HOS2YGL194C 1359 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 KIN28YDL108W 921 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 ECT1YGR007W 972 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 MTW1YAL034W-A 870 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 YLL059CYLL059C 507 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 YLR125WYLR125W 411 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 UIP3YAR027W 708 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 CUS2YNL286W 858 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 PHA2YNL316C 1005 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 YPL014WYPL014W 1146 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 UBC4YBR082C 447 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 TMN2YDR107C 2019 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 IKS1YJL057C 2004 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 PMT4YJR143C 2289 nt4.95□□□□□ -1.62
MDE1P47095 RAD57YDR004W 1383 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 MCH4YOL119C 1506 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 PRP43YGL120C 2304 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 YDR445CYDR445C 408 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 RML2YEL050C 1182 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 MRPL25YGR076C 474 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 SCW4YGR279C 1161 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 YBL044WYBL044W 369 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 YNR048WYNR048W 1182 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 CAB3YKL088W 1716 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 OAF1YAL051W 3144 nt4.94□□□□□ -1.62
MDE1P47095 MMP1YLL061W 1752 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 TPO2YGR138C 1845 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 YDL144CYDL144C 1071 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 COX26YDR119W-A 201 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 YER084WYER084W 387 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 SHE10YGL228W 1734 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 DAM1YGR113W 1032 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 GTO1YGR154C 1071 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 YMR147WYMR147W 672 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 GPM3YOL056W 912 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 PCA1YBR295W 3651 nt4.93□□□□□ -1.62
MDE1P47095 STE7YDL159W 1548 nt4.92□□□□□ -1.62
MDE1P47095 VHC1YBR235W 3363 nt4.92□□□□□ -1.62
MDE1P47095 SPC42YKL042W 1092 nt4.92□□□□□ -1.62
MDE1P47095 SRN2YLR119W 642 nt4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.4 ms