Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL28P46779 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL28P46779 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL28P46779 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL28P46779 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL28P46779 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL28P46779 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL28P46779 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL28P46779 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL28P46779 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL28P46779 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL28P46779 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL28P46779 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL28P46779 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL28P46779 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL28P46779 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL28P46779 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL28P46779 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL28P46779 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL28P46779 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL28P46779 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL28P46779 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL28P46779 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL28P46779 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL28P46779 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL28P46779 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL28P46779 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL28P46779 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL28P46779 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL28P46779 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL28P46779 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL28P46779 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL28P46779 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL28P46779 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL28P46779 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL28P46779 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL28P46779 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL28P46779 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL28P46779 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL28P46779 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms