Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RECQLP46063 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RECQLP46063 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RECQLP46063 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RECQLP46063 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RECQLP46063 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RECQLP46063 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQLP46063 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQLP46063 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQLP46063 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQLP46063 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQLP46063 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RECQLP46063 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RECQLP46063 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQLP46063 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQLP46063 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQLP46063 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQLP46063 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQLP46063 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RECQLP46063 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RECQLP46063 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RECQLP46063 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RECQLP46063 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQLP46063 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQLP46063 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQLP46063 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQLP46063 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQLP46063 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQLP46063 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RECQLP46063 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RECQLP46063 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RECQLP46063 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQLP46063 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQLP46063 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQLP46063 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RECQLP46063 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms