Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACADSBP45954 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms