Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR1P43307 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR1P43307 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR1P43307 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR1P43307 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR1P43307 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR1P43307 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR1P43307 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR1P43307 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR1P43307 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSR1P43307 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSR1P43307 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSR1P43307 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSR1P43307 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSR1P43307 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSR1P43307 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSR1P43307 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSR1P43307 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSR1P43307 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSR1P43307 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSR1P43307 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSR1P43307 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSR1P43307 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSR1P43307 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSR1P43307 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSR1P43307 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR1P43307 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR1P43307 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR1P43307 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR1P43307 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR1P43307 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR1P43307 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR1P43307 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR1P43307 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR1P43307 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR1P43307 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSR1P43307 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms