Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC19A1P41440 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC19A1P41440 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A1P41440 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms