Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2IP36954 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2IP36954 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms