Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK1P35558 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK1P35558 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK1P35558 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK1P35558 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK1P35558 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK1P35558 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCK1P35558 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK1P35558 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK1P35558 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK1P35558 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK1P35558 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK1P35558 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK1P35558 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK1P35558 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCK1P35558 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCK1P35558 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCK1P35558 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCK1P35558 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCK1P35558 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCK1P35558 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCK1P35558 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCK1P35558 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCK1P35558 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCK1P35558 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCK1P35558 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCK1P35558 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCK1P35558 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCK1P35558 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCK1P35558 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCK1P35558 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCK1P35558 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCK1P35558 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCK1P35558 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCK1P35558 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCK1P35558 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCK1P35558 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCK1P35558 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCK1P35558 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCK1P35558 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCK1P35558 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCK1P35558 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCK1P35558 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCK1P35558 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCK1P35558 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCK1P35558 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCK1P35558 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK1P35558 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK1P35558 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK1P35558 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK1P35558 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK1P35558 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK1P35558 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK1P35558 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK1P35558 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCK1P35558 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCK1P35558 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms